常用的色譜固定相基質包括：

硅膠固定相、聚合物微球固定相、金屬氧化物微球固定相。

由于硅膠表面存在大量具有反應活性的硅醇基，同時硅膠基質具有強度好，多孔結構和較好的化學穩定性等優點，因而是一種比較理想的色譜固定相基質材料。硅膠微球固定相不僅具有高效、高選擇性的特點，而且具有比表面積大、較好的色譜性能。

因此，硅膠微球固定相是目前應用zui廣泛的液相色譜填料，尤其是針對有機小分子的高效分離分析，并且占據絕大多數市chang份額。然而硅膠基質化學穩定性較低，一般只能pH為2-8的范圍內操作，否則會發生水解，降低色譜柱的使用壽命，并且由于殘存硅羥基表現出所謂第二效應，特別會使堿性化合物的峰型拖尾，一定程度上限制了硅膠微球固定相在堿性化合物分析中的應用。

雖然硅膠固定相具有柱效高、分離性能好等優點，仍然是目前商品色譜柱的主流。

此類填料存在兩個明顯缺點：

為了克服硅膠固定相和聚合物微球固定相的固有缺點，研究者仍在不斷開發新的基質材料。氧化鋁的分離機理比較復雜，目前表面覆蓋型和表面鍵合正丁基型氧化鋁已經應用于色譜分析，而且表現出良好的性能，但仍不能取代硅膠。氧化鋯及改性氧化鋯同時具有硅膠基質的高機械性能和聚合物基質的優良化學穩定性，因此氧化鋯作為HPLC填料的研究已引起色譜學領域的極大興趣，其原因是氧化鋯耐堿性好，pH適用范圍可達1-14。

同時還具有其他優點：