凝膠滲透色譜柱主要用于高聚物的相對分子質量分級分析以及相對分子質量分布測試。根據分離的對象是水溶性的化合物還是有機溶劑可溶物。
凝膠滲透色譜柱的拆除：
完成實驗分析后，在0.2ml/min的流速下，緩慢將柱溫箱溫度降到室溫。
降至室溫后，要快速地用堵頭將儀器上拆下的色譜柱密封好，避免柱子里面的流動相溢出。
將色譜柱放入到廠家提供的包裝盒中，放置在溫度變化很少的室內，恒溫是較佳選擇。
柱子如長期不用，隔一段時間在儀器上沖洗一下，以確保柱子內的流動相不會揮發殆盡。
凝膠滲透色譜柱的存放：
如果暫時不用，存放時要注意以下幾點：
a.幾天之內的短期放置，凝膠柱則用蒸餾水來沖洗，再把色譜柱的兩頭用密封螺絲密封好即可。
b.如果長期不用，僅用上述方法來處理就不行了，這時應使用色譜柱使用說明書中所指明的溶劑來充滿色譜柱，凝膠柱則不能用水了，因柱內如果有微生物的生長則會使柱效降低，此時應用0.05%的NaNs水溶液(防腐劑)來沖洗色譜柱，再將色譜柱封嚴。長期放置時，一定要將色譜柱的兩端封嚴，以防止由于溶劑揮發而造成的柱填料干縮現象，因這可導致柱效的嚴重降低。
c.應貯存在室溫下，如果放置于0℃以下的環境里，柱內就會結冰，這也將導致柱效的降低。
